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羊水干细胞体外培养早期和后期基因表达谱分析
焦 扬1
昆明医科大学分子临床医学研究院
摘要:
[摘要]目的 探讨羊水干细胞(amniotic fluid stem cells,AFSCs)体外培养早期和后期全基因组表达规律.方法 在公共基因芯片数据库 GEO 中找到羊水干细胞相关的基因芯片数据,使用 R和Bioconductor软件包对其进行统计学分析,筛选差异表达基因,并进行GO分析和KEGG通路分析.结果 通过线性模型没有找到差异表达基因,而通过秩积法找到217个上调探针,278个下调探针.对这些差异表达基因进行功能富集,上调的生物过程是胶原纤维组织相关过程、细胞外基质组织、胞外结构组织、骨骼系统发育、细胞粘附等.下调过程最显著的是核分裂过程,有丝分裂以及细胞周期相关过程.上调的通路为ECM受体交互通路和焦点粘附通路.下调通路分别是细胞周期,细胞因子受体交互通路,p53信号通路和卵母细胞减数分裂通路.结论 体外培养中AFSCs能很好地维持基因的表达.
关键词:  [关键词]羊水干细胞  体外培养  基因表达
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